Es normal que un bebé de 2 años vomite flemas después de nebulizarlo ?

Esperado.

Así es, es una posibilidad, sobre todo después de un acceso de tos, las nebulizaciones entre uno de sus objetivos es el hacer más fluidas las flemas, especialmente le ayudan a los niños como tu bebé, que por la edad se dificulta la expulsión voluntaria de las mismas. Hay que asistirlo cuando esté sucediendo esto para evitar accidentes con el vómito y apapacharlo, porque seguro se asusta.
Siempre teniendo en cuenta los datos de alarma de dificultad respiratoria: cambio de coloración en la piel (moradito), movimientos del pecho exagerados para respirar, silbiditos que salen de su garganta cuando respira.