En febrero me recetaron metrigen fuerte para inducir la menstruación y comenzar un tratamiento para

Si. Lo puedes volver a inyectar, sin embargo no me parece un tratamiento muy amigable (por ser inyectado); si lo que buscas es ÚNICAMENTE regularizar tu menstruación podrías utilizar algun medicamento como provera (Acetato de Medroxiprogesterona) por vía oral la segunda quincena de cada mes y al suspender tendras un sangrado menstrual regular. Por otro lado si tienes múltiples quistes pequeños en el ovario, quizá tengas síndrome de ovario poliquístico y necesitas otro tratamiento no sólo para regularizar el ciclo menstrual sino para corregir el problema de base.